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Photorespiration

Le cycle de Calvin et le processus concurrent appelé photorespiration (également initié par Rubisco). Créé par Sal Khan.

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Transcription de la vidéo

dans cette vidéo je vais passer en revue le cycle de calvin qu'on a déjà vu dans la vidéo précédente mais en ajoutant des précisions et surtout pour montrer quel type de réaction inefficace peuvent avoir lieu dans la cellule le végétal donc lors du cyclone de calvin on avait vu qu'on pouvait incorporer le carbone présent dans le dioxyde de carbone fixé ce carbone grâce à l'intervention de rugby lol by phosphates et de l'envié me ruby sco et on avait pris six molécules de carbone et six molécules de riz buloz pour des soucis d'équilibré la réaction à l'arrivée au niveau du glucose donc on va continuer comme ça ces molécules réagissait ensemble grâce à l'enzyme ruby scones que je la mette au milieu puisque elle gouverne ce cycle dans une rue bisco remise aux bisphosphonates carbox il a zo oxygénante et elle permet à partir de cette molécule avec un sol carbone je représente est ici et cette molécule à 5 carbone sans carbone et deux groupements phosphates elle leur permet de réagir et on a vu qu'on obtenait 12 molécules de glisse et aldéhydes triphosphate mais en fait il y à des intermédiaires et le premier intermédiaire de réaction qu'on a c'est le trois fosses fogli seat trois fosses faut glisser rate qui est une molécule à 3 carbone et phosphorées les je vais représenter comme ça alors ça peut sembler très très similaire au glissé khalid triphosphate qui est aussi représentée comme une molécule à 3 carbone phosphorer les mais pour des raisons de liaison avec les hydrogène et les molécules d'oxygène mais pour des raisons de liaison avec les atomes d'hydrogène et d'oxygène cette molécule a n'est pas prête encore pour pouvoir à permettre la fabrication de glucose donc on a encore besoin de réaction qui permettent de changer sa conformation pour pouvoir arriver au glissé râleries triphosphate qui lui est propice à la formation du glucose donc on va avoir dans un premier temps ajout d'un second groupement phosphate pour obtenir le biphobie ses actes le bi phospho il se rate qui est toujours une molécule à 3 carbone cette fois ci avec deux groupements hausse est donc un côté sas a consommé de la tp qui a donné les groupements phosphate qu'on a ici consommation de 12 molécules d'atp comme on avait déjà vu dans la vidéo précédente et on récupère 12 molécules date dp puisque les phosphates ici reste sur cette molécule de biche au saut du lit c'est rare qu'on avait ici 12 molécules de trois fosses pirates qui ont nécessité l'ajout de 12 rounds phosphate pour donner ses douze molécules de biphobie certes et ensuite et bien subi phospho viscérale a besoin d'être réduits et de perdre ce groupement phosphate pour pouvoir arriver au lycée rallye triphosphate et c'est là qu'on va voir intervention du n ad ph le nahd et ph va donner sa liaison à l'hydrogène elle n'a des péages devient n adp plus et permet la réduction du bisso blessés at on glissé rallye très phosphate ainsi que le rejet des groupements phosphates on a tous groupement phosphates qui seront relâchés et ici on avait 12 de chaque 6,12 mdph qui sont utilisés et donc voilà à partir de ces douze lycées khalid triphosphate on avait vu qu'on pouvait en utiliser deux pour pouvoir les dédié à la création de glucose et que 10 molécules pouvait repartir dans le cycle et reformer la réserve de rébus l'osbi fawcett donc ça ça nécessite à nouveau de l'atp en l'occurrence six molécules l'atp et récupère de la dp le groupement phosphate lui reste lié sur la molécule de ribul aux finales donc voilà ça c'était déjà pas mal de la revue par rapport à ce qu'on avait vu dans la première vidéo sur le cycle de calvin on a ajouté ici des intermédiaires de réaction certains cours de biologie passe dessus et en fait ça donne l'occasion de voir à quel moment interviennent l'atp et le net des ph avec ici dont deux groupements phosphate est ici réduction et perte du groupement phosphate est donc cette version du cycle justement c'est le fait que ce premier intermédiaire de réactions soient ceux trois fosses faut glisser rate une molécule à 3 carbone est bien un appel ça la fixation du carbone en c3 ou photosynthèse c3 ça c'est la photosynthèse en c3 et donc les plantes qui vont utiliser cette version du cycle on va les appeler les plantes en c3 par opposition à des plantes qui ont pour premier intermédiaire une molécule à 4 carbone qu'on appellera les plantes en c4 ça on va en reparler plus tard donc à part les quelques petites précisions en terme l'intermédiaire ce dont je voulais parler dans cette vidéo c'est une autre réaction possible avec ruby sco qui dépend justement de l'autre la deuxième partie de son monde puisque ruby sco c'est ribul osbi phosphate carmaux oxylane oxygène has et bien cette enzyme elle permet la réaction avec le dioxyde de carbone mais aussi avec l'oxygène si on a de l'oxygène dans l'environnement le rib l'osbi phosphate pour agir avec donc en l'occurrence cinq molécules de riz buloz pour une molécule d'eau toujours en présence de cette enzyme briscoe et cette réaction va couper en deux cette molécule de riz buloz mais recule à 5h bonne pour former deux produits un produit à 3 carbone qui est dû un produit à 3 carbone qui va être ce faust phobie ceyrat là même la même molécule fausse phobie ceyrat est une molécule à 2 carbone puisque trois plus de ça fait 5 une molécule à 2 carbone qui sera du phosphore glico lattes phospho glico lattes donc on en récupère 5 de chaque on a en fait en quelque sorte découper cette molécule de rébus l'osbi phosphate pour obtenir ici une molécule à 3 carbone phosphorer les est une molécule à 2 carbone phosphorer les alors cette réaction là qui a lui aussi elle est absolument pas efficace puisque ce phosphorique au late tout ce qu'on en sait pour l'instant c'est que c'est un déchet de réaction ça va se diriger vers le peroxyde hommes vers le peroxyde homme pour être dégradée et ne va pas rentrer dans la fabrication du glucose tandis qu'ici le phosphore glissé raté bien une partie peut éventuellement continuer vers du glycérol des triphosphate et éventuellement informations de glucose on peut éventuellement repartir vers du riz buloz mais avec cinq fausses faut glisser rate on n'aura pas à reconstituer les cinq villes aux phosphates de départ et donc on va avoir progressivement utilisation épuisement du stock de riz bulle haute avec en prime utilisation des ressources en atp donc cette version de la réaction en espèces à la photo respiration ici c'est la faute aux respirations puisque eh bien on a utilisation de l'oxygène on à oxydation mais qu'un rendement absolument inintéressant pas du tout bénéfique à la plante parce que si elle veut conserver ses ressources henri buloz et bien elle va passer du foso glissé rade à nouveau vers le riz buloz on en perdant une partie à cause de ce faux ce bricolage et en ayant utilisé de la tp sans pour autant avoir produit de glucose ou bien elle va produire du glucose mais elle va complètement asséché ses réserves en red bull aux donc ça on connaît on n'a pas très bien compris encore bon on considère le faux sung illico lattes comme un déchet de réaction quand quelque chose d'inutile et est dans la nature bien l'évolution a horreur du gâchis donc cette réaction là on se demande bien à quoi elle peut servir alors qu'il ya des gens qui font l'hypothèse que c'est un reste d'une époque ancienne puisque bon les plans sont des carrioles donc qu'ils sont comme nous issu de la réaction symbiose entre plusieurs organismes on pense éventuellement que ça vient d'une époque où l'oxygène et terreur dans l'environnement et que donc cette réaction là était peu susceptible d'arriver donc n'étaient pas forcément gênante donc cette enzyme qui avaient les deux fonctions et bien elle était utilisée vraiment principalement pour ce cycle de calvin et ça n'arrivait que très rarement et que donc c'est aussi un reste de cette époque là ou bien l'autre hypothèse c'est que et bien la présence d'oxygène dans l'environnement au niveau de la cellule là où se passe la photosynthèse et bien ça peut être dangereux pour la cellule puisque le dioxygène ne peut réagir peut aller oxydé d'autres espèces d'autres molécules et endommagé la plante est donc ça serait un moyen on coûteux mais à ce sera un moyen de parvenir à éliminer cet oxygène qui seraient présents dans l'environnement donc voilà on a revu le cycle de calvin en bien en détail avec les intermédiaires de réaction donc voilà dans cette vidéo on a pu voir qu'il existait un phénomène de photos respiration qui fait intervenir l'oxygène et qui est coûteuse à la cellule ainsi que de repasser en détail le cycle de calvin et ses intermédiaires de réactions et notamment le faisceau de laisser rate qui donne son nom fixation du carbone en c3 où fausto synthèse en c3 et justement par opposition à la fixation en c4 dont on va pouvoir maintenant voir le détail